Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMA5P28066 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms