Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAV1P15498 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAV1P15498 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms