Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
GP1BBP13224 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms