Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB7P09629 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms