Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CSF2P04141 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CSF2P04141 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms