Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CALUO43852 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CALUO43852 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CALUO43852 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms