Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SDR42E2A6NKP2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms