Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms