Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CIZ1Q9ULV3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms