Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SNX15Q9NRS6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms