Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SSU72Q9NP77 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SSU72Q9NP77 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms