Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CYP4F12Q9HCS2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms