Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KDM5DQ9BY66 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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