Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS5

AP1M1, AP-1 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1M1Q9BXS5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AP1M1Q9BXS5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms