Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SLF1Q9BQI6 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms