Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
VAT1Q99536 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms