Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TCF12Q99081 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TCF12Q99081 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms