Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C18orf8Q96DM3 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C18orf8Q96DM3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms