Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKD2Q969F2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms