Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TAF4BQ92750 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms