Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNAAF3Q8N9W5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms