Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GDF6Q6KF10 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms