Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV67

PPRC1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPRC1Q5VV67 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPRC1Q5VV67 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPRC1Q5VV67 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms