Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDO1Q16878 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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CDO1Q16878 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDO1Q16878 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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CDO1Q16878 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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