Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HADHQ16836 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HADHQ16836 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms