Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 GRAMD1B-216ENST00000638157 3849 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
USF2Q15853 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ACSL4-202ENST00000348502 5032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
USF2Q15853 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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