Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TRIM25Q14258 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TRIM25Q14258 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms