Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PKP1Q13835 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PKP1Q13835 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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