Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
EIF4EBP1Q13541 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
EIF4EBP1Q13541 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms