Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 UGT1A10-202ENST00000373445 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PDAP1Q13442 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 SNTG1-202ENST00000518864 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PDAP1Q13442 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms