Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SLAMF1Q13291 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms