Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CHAF1AQ13111 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CHAF1AQ13111 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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