Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRAF1Q13077 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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