Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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CSTF3Q12996 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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