Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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EFEMP1Q12805 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFEMP1Q12805 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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