Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RIPPLY1Q0D2K3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms