Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DSC1Q08554 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms