Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
SRSF2Q01130 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SRSF2Q01130 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms