Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PREX1-201ENST00000371941 6636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX1P83916 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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