Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSE1LP55060 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSE1LP55060 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms