Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GEMP55040 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GEMP55040 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GEMP55040 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms