Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
COPAP53621 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPAP53621 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
COPAP53621 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPAP53621 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms