Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ME1P48163 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ME1P48163 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ME1P48163 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms