Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GCAP28676 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GCAP28676 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GCAP28676 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms