Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB5P28074 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms