Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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CCNA2P20248 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CCNA2P20248 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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