Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NFKB1P19838 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms