Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA4P06727 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms