Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KNCNA6PVL3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KNCNA6PVL3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms