Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF346Q9UL40 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF346Q9UL40 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF346Q9UL40 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF346Q9UL40 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
ZNF346Q9UL40 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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